良いシステムですね。導入していただけるなら是非お願いしたいです。
その気になれば一度に10勝まで出来るので、ログイン間隔の広い人も楽しめそうなのも良い点かなと。
以下、新仕様について気になった点について述べます。

・出場料
順位を飛ばす場合の出場料は、得られる賞金の差額＋αだけ増加するようにしてはいかがでしょうか？
基本は１つ上、どうしても避けたいなら順位飛ばし、という形が自然のように思います。
ただ順位飛ばしが多いほどコロシアムは良く回るので、出場料一定のほうが良い結果を生むかもしれません。

・ボスの扱い
初期状態でコロシアム１位に設定されているNPCチーム(ボス)ですが、
新仕様だと１人が突破すると、後は順位飛ばしで一気にランク外になるかもしれません。
問題ないといえばそうなのですが、攻略狙ってるプレーヤーには厳しい仕様かと思います。

・上位の停滞
新仕様では全体的に順位の変動が起こりやすいのですが、
やはり上位になるほど順位変動は鈍くなってしまうと予想されます。
１位の特権として一定額の支払いでランキングから外れる(引退？)というシステムを導入してみてはいかがでしょうか？

コロボスを複数回狩れるなどの問題も生じてしまうのですが、
対人戦をしたければ上位になるな、というような状況は改善すべきだと思います。