○上位MS魔術とファミリア
どちらかをと言われれば、上位MS魔術を取り上げるべきかと思います。
前にも書きましたが、Cru以外の青系列が威力400オーバーの武器（しかも魔術）を扱えてしまうのはどうなんだろうと思いますので。
（そういう意味ではPriからジャイアントモールやスレッジハンマーは取り上げるべきだと思っていますが……スレ違いですね）

ただ、ファミリアも残しておくべきかというとどうなんでしょう？
個人的には今後問題になったときに取り上げればいいと思いますが、もともとファミリアはSor用のモノらしいですし、Druが扱えることによるメリットが大きすぎるのであればこちらも取り上げてしまってよいのかも知れません。
代わりにMS感応（スピリット・○○）をリリースするとか？

○物理装甲と盾の取り上げ
盾については正直どちらでもいいですね。
取り上げると受流が死にアビになりますが、Bisなんかも召喚が死にアビとなってるわけですしそれはそれで。
ＧＦ３回優勝（バキュラ）のことを考えると、バックラーぐらいは残しておいて良い気はしますが……
防壁メインに絞るのであれば仰られるようにアクティブガーダーは欲しいですね。

イメージの話をするなら狼や精霊を呼んで自身は熊になって殴りかかるのが自分のDru像ですので、早く格闘武装開放されないかなーとか。