属性武器についてはほとんど使ったことがないので門外漢ですが思ったことなど書いて行こうと思います。

＞「魔術改造の改造効果の性能下げてほしーなー」という所です。

＞■属性がほぼ気楽に変える事ができてしまっているため、

もしバランスが取れていないと考えるなら、「属性が変更されたときに改造効果が下がる」（または「属性が変更されないときに改造効果が増える」）というのがいいんじゃないかなと思います。
火魔法→風魔法
無物理→水物理
は下がるけど、
土魔法→土魔法
火E→火E
なら通常の通りという感じで。
（マテリアルに関しては例外）


＞■まず闇属性化の改造リスクが非常に少なくなってきている
武器に関しては四属性武器なら最大15〜25%もらえるところが闇属性武器では10%固定なので必ずしも闇武器一択にはならないかと思います。
闇属性を作る選択肢がある点は魔術武器の強みですが、常に闇武器が四属性武器より強いわけではないんじゃないのでそんな問題になっていないかなと。

防具に関しては闇属性防具なら光以外は一律-5%に対して四属性は同じ属性に対して-5%反属性に+5%と、闇有利なのかなぁとは思います。
四属性については±10%とかにすればマテリアルシールドの立場が上がったりするかもしれません。