人数的に合わない場合を除き（8チームの枠に同系統のクラスが9人以上参加）GFでのチーム戦で同クラス同士が組む事への制限を提案します。
理由は同クラス同士が組む事を排除することで、チームがある程度平均化され、多少は公平な組み合わせになると思うのですがどうでしょうか。

問題があるとすれば、アドバンスクラスが出てきた際に複合クラス、新クラスのくくりをどうするかが難しいと思います。
GF優勝商品別に分けるのが無難なのかなぁとは思います。
※1stブレード入手可能な機体、レイガン入手可能な機体。。といったくくり。