活躍点（行動回数×20）から損害点（元耐久−残耐久）を引いたものを個人の得点として､
各チームで合計、チーム人数で割って、個人点の平均が上回ったほうが勝ち､というのはどうでしょうか？

Wは氣武器で相手の損害点を増やすことで､
FとSは平均的に、
Tは行動回数が多いことで､
MとGは損害点が少ないことで､
Cは損害点を減らすことで､
それぞれ勝利に反映されることになります。

部位を落としても損害点を増やすことができますし､
撃墜すれば損害点は大きいですし､それ以降活躍点を稼がれることがありません。
活躍点の係数20はざっと考えた係数なので､テストしてバランスをとればいいと思います。
途中の行動には影響しないので､タイムアップ後に残っている変数で一度計算するだけで、
システム的な負担もほとんど無いと思います。

いかがなものでしょうか？