私も一つ意見を。

与えたダメージの合計値が大きいほうが勝ち。
部位破壊が起きた場合はその部位の元の残り耐久値がポイントとなる感じで。
回復した分は相手のポイントからマイナスするとか。
計算も簡単そうです。