特に触れられていない点について落穂拾い的にコメントしてみます。

・属性の共鳴について
以前は弱点20％と耐性20％で、平均を取ると±0でしたが、
共鳴を起こすと一律10％威力がアップし、平均も＋10％となります。
光属性や闇属性の武器も基本的に平均で＋10％のため、
これらのレアリティーが若干引き下げられていると思います。

・クエストについて
クエスト全般の敵データをざっと見てみました。
属性効果により、以前より火力が上がっている敵も下がっている敵もいるようですが、
割合的には前者の方が多く、全体として強化の傾向にあるようです。

プレイヤーサイドでも敵に合わせて武器を選べますが、弱点を突こうとすると
以前と比べて機体属性により±10％で修正が入ります。

総じて、クエスト難度の変化を懸念します。
これまで少しずつクエストの調整が行われてきたと思いますが、
再調整が必要となってしまうものもあるのではないでしょうか。
＃この辺の調整作業の労力がどれほどのものかという所を最も心配しております。

特に、「時凍る果て…？」のほとんどの敵と、ID:300が凶悪になっていると思います。
逆にID:170はボス敵なのに可哀想なことになっています。

・最後に
属性の循環等、面白いシステムだと思います。
ただ、慣れるまではメモ片手のプレイが必須になりそうで、やはり複雑なのかなと思います。